南京市排名前五十的大学包括以下几所：
1. 南京大学
2. 东南大学
3. 河海大学
4. 南京农业大学
5. 南京师范大学
6. 南京理工大学
7. 南京航空航天大学
8. 南京工业大学
9. 南京邮电大学
10. 中国药科大学
11. 南京医科大学
12. 南京信息工程大学
13. 南京林业大学
14. 南京中医药大学
15. 南京财经大学
16. 南京审计大学
17. 南京工程学院
18. 南京晓庄学院
19. 江苏第二师范学院
20. 金陵科技学院
21. 南京特殊教育师范学院
22. 南京航空航天大学
23. 南京理工大学
24. 河海大学
25. 南京农业大学
26. 南京师范大学
27. 中国药科大学
28. 南京医科大学
29. 南京信息工程大学
30. 南京林业大学
31. 南京中医药大学
32. 南京工业大学
33. 南京财经大学
34. 南京审计大学
35. 南京工程学院
36. 南京晓庄学院
37. 江苏第二师范学院
38. 金陵科技学院
39. 南京特殊教育师范学院
40. 南京航空航天大学
41. 南京理工大学
42. 河海大学
43. 南京农业大学
44. 南京师范大学
45. 中国药科大学
46. 南京医科大学
47. 南京信息工程大学
48. 南京林业大学
49. 南京中医药大学
50. 南京工业大学
请注意，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准而有所变化，以上信息以最近发布的排名为准。如果您需要更详细的信息，请告诉我
