根据教育部全国第四轮学科评估结果，云南农业大学植物保护、畜牧学被评为B类学科。作物学、农业资源与环境、草学、食品科学与工程、园艺学、农业工程被评为C类学科。
| 学科 | 学科评级 | 所属专业类 |
|---|---|---|
| 植物保护 | B | 农学 |
| 畜牧学 | B | 农学 |
| 学科 | 学科评级 | 所属专业类 |
|---|---|---|
| 作物学 | C+ | 农学 |
| 农业资源与环境 | C | 农学 |
| 草学 | C | 农学 |
| 食品科学与工程 | C | 工学 |
| 园艺学 | C- | 农学 |
| 农业工程 | C- | 工学 |
| 科学技术史 | C- | 理学 |
| 评估结果 | 全国排名 |
|---|---|
| A+ | 前2%（或前2名） |
| A | 2%～5%（不含2%，下同） |
| A- | 5%～10% |
| B+ | 10%～20% |
| B | 20%～30% |
| B- | 30%～40% |
| C+ | 40%～50% |
| C | 50%～60% |
| C- | 60%～70% |
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